Основной путь передачи гонореи от больного к здоровому - половой. Внеполовым путем гонореей в основном заражаются дети, преимущественно девочки (от зараженных гонореей матерей). Заражение гонореей происходит через общую постель, белье, мочалки, и др. Возможно гонорейное поражение газ и влагалища при рождении ребенка, когда ребенок проходит по зараженным гонореей родовым путям матери

В глотке, слизистой оболочке рта, миндалинах, прямой кишке, гонорейный процесс может возникнуть при нестандартных половых сношениях. Восприимчивость людей к гонорее высокая. Врожденного или приобретенного иммунитета к гонорее не существует. Так что вполне возможны повторные заражения гонореей (реинфекции). Попав на слизистую оболочку, гонококки через различное время вызывают в ней гонорейный воспалительный процесс.
Продолжительность инкубационного периода гонореи обычно 3 - 5 дней, однако инкубационный период гонореи может колебаться от 1 дня до 3 недель.Гонококки вызывающие гонорею , начав размножатся на слизистой мочеиспускательного канала постепенно вовлекают в гонорейный процесс, близлежащие ткани и могут проникнуть в придатки яичка. предстательную железу, семенные пузырьки, придатки матки, прямую кишку.
В лимфатических путях и кровяном русле гонорея быстро погибает, хотя иногда гонорея может переноситься в суставы, сердце, брюшину, мозговые оболочки. Гонорея с локализацией в отдаленных от первичного очага гонорейного поражения, относится к осложненным формам гонореи.